Ajout de packages dans des distributions atomiques

Cette note fait partie de la série de notes : "J'ai étudié et testé CoreOS et je suis tombé dans un rabbit hole 🙈".

Note précédente : "Peu à peu depuis 2015, le terme immutable est remplacé par atomic".

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Je constate que la plupart des personnes avec qui j'échange pensent qu'une distribution immutable ne permet que d'exécuter des containers Docker ou des applications Flatpak.
En réalité, grâce à la technologie libostree, il est possible d'installer des packages Fedora sur une instance Fedora CoreOS.

Voici un exemple sous Fedora CoreOS que j'ai réalisé avec le playground suivant : https://github.com/stephane-klein/atomic-os-playground.

Je commence par regarder l'état de l'OS avec rpm-ostree status :

stephane@stephane-coreos:~$ rpm-ostree status
State: idle
AutomaticUpdatesDriver: Zincati
  DriverState: active; periodically polling for updates (last checked Sat 2025-09-27 12:43:23 UTC)
Deployments:
● ostree-remote-image:fedora:docker://quay.io/fedora/fedora-coreos:stable
                   Digest: sha256:d196ab492e7cadab00e26511cdc6b49c6602b399e1b6f8c5fd174329e1ae10c1
                  Version: 42.20250901.3.0 (2025-09-14T22:45:05Z)

Je constate que la version 42.20250901.3.0 identifiée par le commit sha256:d196ab...ae10c1 est installée.
Cette version correspond au moment où j'écris cette note à la dernière release du stream stale listé sur cette page https://fedoraproject.org/coreos/release-notes?arch=x86_64&stream=stable.

Maintenant, j'utilise rpm-ostree install … pour installer neovim.

stephane@stephane-coreos:~$ sudo rpm-ostree install neovim
Checking out tree 1e5b81c... done
Enabled rpm-md repositories: fedora-cisco-openh264 updates fedora updates-archive
Updating metadata for 'fedora-cisco-openh264'... done
Updating metadata for 'updates'... done
Updating metadata for 'fedora'... done
Updating metadata for 'updates-archive'... done
Importing rpm-md... done
rpm-md repo 'fedora-cisco-openh264'; generated: 2025-03-19T16:53:39Z solvables: 6
rpm-md repo 'updates'; generated: 2025-09-27T01:07:36Z solvables: 24410
rpm-md repo 'fedora'; generated: 2025-04-09T11:06:59Z solvables: 76879
rpm-md repo 'updates-archive'; generated: 2025-09-27T01:38:59Z solvables: 44216
Resolving dependencies... done
Will download: 40 packages (121.6 MB)
Downloading from 'updates'... done
Downloading from 'fedora'... done
Importing packages... done
Checking out packages... done
Running systemd-sysusers... done
Running pre scripts... done
Running post scripts... done
Running posttrans scripts... done
Writing rpmdb... done
Writing OSTree commit... done
Staging deployment... done
Added:
  binutils-2.44-6.fc42.x86_64
  compat-lua-libs-5.1.5-28.fc42.x86_64
  ...
  neovim-0.11.4-1.fc42.x86_64
  ...
Changes queued for next boot. Run "systemctl reboot" to start a reboot

Neovim a bien été installé, mais je dois reboot pour l'utiliser. Voici ce que me dit rpm-ostree status :

stephane@stephane-coreos:~$ rpm-ostree status
State: idle
AutomaticUpdatesDriver: Zincati
  DriverState: active; periodically polling for updates (last checked Sat 2025-09-27 12:48:33 UTC)
Deployments:
  ostree-remote-image:fedora:docker://quay.io/fedora/fedora-coreos:stable
                   Digest: sha256:d196ab492e7cadab00e26511cdc6b49c6602b399e1b6f8c5fd174329e1ae10c1
                  Version: 42.20250901.3.0 (2025-09-14T22:45:05Z)
                     Diff: 40 added
          LayeredPackages: neovim

● ostree-remote-image:fedora:docker://quay.io/fedora/fedora-coreos:stable
                   Digest: sha256:d196ab492e7cadab00e26511cdc6b49c6602b399e1b6f8c5fd174329e1ae10c1
                  Version: 42.20250901.3.0 (2025-09-14T22:45:05Z)

La pastille ● m'indique la version (nommée déploiement) actuellement utilisée par l'instance.

Lors du démarrage du serveur, grub est configuré pour booter sur le premier déploiement de la liste. Exemple :

Une fois le serveur démarré, je peux voir que la version 42.20250901.3.0 est toujours utilisée, mais avec en plus un layer qui contient le package neovim :

[stephane@stephane-coreos ~]$ rpm-ostree status
rpm-ostree status
State: idle
AutomaticUpdatesDriver: Zincati
  DriverState: active; periodically polling for updates (last checked Sat 2025-09-27 13:04:36 UTC)
Deployments:
● ostree-remote-image:fedora:docker://quay.io/fedora/fedora-coreos:stable
                   Digest: sha256:d196ab492e7cadab00e26511cdc6b49c6602b399e1b6f8c5fd174329e1ae10c1
                  Version: 42.20250901.3.0 (2025-09-14T22:45:05Z)
          LayeredPackages: neovim

  ostree-remote-image:fedora:docker://quay.io/fedora/fedora-coreos:stable
                   Digest: sha256:d196ab492e7cadab00e26511cdc6b49c6602b399e1b6f8c5fd174329e1ae10c1
                  Version: 42.20250901.3.0 (2025-09-14T22:45:05Z)

Neovim est bien accessible :

[stephane@stephane-coreos ~]$ nvim --version
nvim --version
NVIM v0.11.4
Build type: RelWithDebInfo
LuaJIT 2.1.1748459687
Run "nvim -V1 -v" for more info

Avec la commande rpm-ostree apply-live il est même possible de commencer à utiliser le package sans avoir à reboot.
Cette fonctionnalité doit se limité à des petits utilitaires. Pour les composants systèmes, il est conseillé d'effectuer un reboot.

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Note suivante : "Système de mise à jour d'Android, Chrome OS, MacOS et MS Windows".